Корейский институт стандартов и науки (KRISS) представил инновационную аналитическую систему, которая отличается повышенной чувствительностью.
Система предназначена для выявления мельчайших следов генетических повреждений, что может способствовать обнаружению злокачественных новообразований на ранних стадиях и адаптации лечения под конкретного пациента. Об этом сообщается на портале Phys.
org.
Ежедневно структура ДНК человека подвергается воздействию ультрафиолетового излучения, внешних токсинов и побочных продуктов обмена веществ.
Внутриклеточные механизмы репарации устраняют эти дефекты, вырезая повреждённые участки. В результате в биологических жидкостях остаются короткие фрагменты — sedDNA.
Их концентрация показывает, насколько активно идёт восстановление, а также как организм реагирует на лекарственное воздействие или контакт с канцерогенами.
Ранее использовавшиеся методы подсчёта таких фрагментов приводили к систематическим погрешностям.
Они основывались на прикреплении химических меток к концам цепочек, но если эти концы были модифицированы внутриклеточными ферментами, маркер не фиксировался. Это приводило к занижению реального числа повреждённых молекул.
Авторы работы преодолели это ограничение, применив формат конкурентного иммуноанализа. На специальный планшет наносят искусственные олигонуклеотиды, повторяющие структуру повреждённого участка, — они играют роль референтного образца.
Затем биоматериал пациента смешивают с антителами, настроенными на поиск дефектов. Антитела конкурируют за связывание: часть уходит к эталону, часть — к фрагментам из пробы.
Чем больше искомых фрагментов содержится в образце, тем слабее сигнал от планшета. Такой подход позволяет рассчитать молярную концентрацию с высокой точностью даже при содержании всего нескольких тысяч копий.
Доктор Чой Джун-Хюк, руководитель исследовательской группы, отметил, что количественная оценка активности репарационных систем может стать основой для прогнозирования онкологических рисков задолго до появления клинических проявлений. Кроме того, методика позволяет объективно отследить чувствительность опухоли конкретного больного к противораковым препаратам.
Учёный добавил, что для внедрения в клиническую практику необходимы дальнейшие испытания на образцах человеческих тканей, которые подтвердят эффективность подхода и позволят разрабатывать индивидуальные терапевтические схемы.